El Instituto Mexicano de Trasplantes ha conformado un grupo selecto de Investigadores, Subinvestigadores y Coordinadores de Estudio con el que se realizan  Protocolos de Investigación para Laboratorios Farmacéuticos de empresas internacionales de renombre.

Uno de los Objetivos del Instituto Mexicano de Trasplantes, S.C. es llevar a cabo Investigaciones clínicas en el campo de los trasplantes, que permita generar información y la creación de nuevos y mejores medicamentos aplicables a la población mexicana; así como investigaciones científicas en general encaminadas a la atención más eficiente y humana de los pacientes.

Dentro de la Epecialidad de Urología también se desarrolla un Protocolo de Investigación de Cáncer de Próstata el cual busca mejores tratamientos para los pacientes que lo padecen.

La Especialidad de Nefrología desarrolla un Protocolo de Investigación para pacientes con Insuficiencia Renal Crónica con el cual se busca retrasar el tiempo en el que el paciente necesite la utilización de terapia sustitutiva, es decir, diálisis peritoneal, hemodiálisis o trasplante renal.

Trabajamos en conjunto con el Comité de Ética en Investigación, Comité de Investigación y el Comité de Bioseguridad quienes se encargan de aprobar y dar seguimiento a todos los estudios de investigación en seres humanos.